Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms