Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms