Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms