Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FAM71E2Q8N5Q1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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