Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
VPS8Q8N3P4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS8Q8N3P4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms