Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms