Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF554Q86TJ5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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