Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms