Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH2D5Q6ZV89 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms