Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC73Q6ZRK6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms