Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF493Q6ZR52 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms