Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms