Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 311.89□□□□□ -0.516e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 410.61□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 34.37□□□□□ -1.716e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ATF6B-217ENST00000495579 1176 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ATF6B-212ENST00000468502 564 ntTSL 29.96□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RCC1-212ENST00000486790 481 ntTSL 523.05■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.124e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF740-204ENST00000552593 966 ntTSL 321.65■■□□□ 1.064e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NFKBIB-205ENST00000575359 543 ntTSL 320.96■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.944e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-213ENST00000520941 592 ntTSL 419.2■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF653-205ENST00000590548 2016 ntTSL 219.07■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 418.48■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-15■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 POLD2-211ENST00000464871 580 ntTSL 316.87■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RNF146-209ENST00000608340 512 ntTSL 416.71■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF2B3-202ENST00000372182 705 ntTSL 316.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.237e-10■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TFEB-208ENST00000416140 1022 ntTSL 516.46■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 MON2-208ENST00000549378 1689 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM231-210ENST00000615437 1003 nt16.24■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-213ENST00000496248 468 ntTSL 416.08■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-22■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.124e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF2B3-206ENST00000480675 1082 ntTSL 515.82■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 TFEB-207ENST00000406563 1626 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 TFEB-210ENST00000419574 984 ntTSL 315.44■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 MTMR10-203ENST00000564787 631 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 MPP1-206ENST00000417435 970 ntTSL 515.03■□□□□ -04e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CREBRF-202ENST00000517882 544 ntTSL 414.91□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 TFEB-209ENST00000419396 914 ntTSL 514.77□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.114e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-10■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SDHB-203ENST00000466613 828 ntTSL 214.31□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ABCB9-205ENST00000426173 2134 ntTSL 214.18□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TSN-207ENST00000483698 555 ntTSL 214.16□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.144e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM231-202ENST00000561809 560 ntTSL 314.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ABTB2-202ENST00000530814 566 ntTSL 413.91□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RNF146-212ENST00000609944 516 ntTSL 513.82□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PLXNB3-208ENST00000485980 773 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBED5-205ENST00000526852 789 ntTSL 413.68□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 WRAP53-208ENST00000498114 507 ntTSL 213.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF2B3-205ENST00000477953 828 ntTSL 513.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 WRAP53-207ENST00000471973 998 ntTSL 313.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-219ENST00000514122 579 ntTSL 413.6□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NFKBIB-203ENST00000509705 2200 ntTSL 213.54□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 30.4
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