Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRC8EQ6NSJ5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms