Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms