Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms