Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms