Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms