Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIF1Q5UIP0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIF1Q5UIP0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIF1Q5UIP0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIF1Q5UIP0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms