Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIF1Q5T3J3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms