Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZK1Q5T2W1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDZK1Q5T2W1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms