Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD1Q5SYB0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms