Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMC4Q5J8M3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms