Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC58Q4VC31 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC58Q4VC31 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms