Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A52Q3SY17 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms