Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms