Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms