Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms