Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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