Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms