Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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