Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms