Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms