Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms