Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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