Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms