Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms