Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCF4Q15080 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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