Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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