Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H2Q13888 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms