Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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