Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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