Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms