Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms