Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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