Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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