Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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