Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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