Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RIGQ13278 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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