Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FOXC1Q12948 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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